Die Spitalleitung trifft strategische Entscheidungen und definiert Leitlinien für die Weiterentwicklung der beiden Stadtspitäler:

• Prof. Dr. med. Patrice M. Ambühl ((Leiter Departement Medizinische Institute und Stellvertretender Spitaldirektor))
• Irmela Apelt (Leiterin Departement Human Resources)
• Stefan Beyeler (Leiter Departement Digitalisierung und Informatik)
• Sven Geissler (Leiter Departement Betrieb)
• Patrick Witschi (Leiter Departement Pflege, Soziales, Therapien a. i.)
• Prof. Dr. med. Lars C. Huber (Leiter Departement Innere Medizin)
• KD Dr. med. Stephanie von Orelli (Leiterin Departement Frau, Mutter, Kind)
• Prof. Dr. med. Dr. h.c. Markus Weber (Leiter Departement Chirurgie)
• Prof. Dr. med. Dominik Weishaupt (Leiter Departement Medizinische Plattformen)
• Marc Widmer (Leiter Strategie und Finanzen)
• André Zemp (Spitaldirektor)
• Prof. Dr. med. Andreas Zollinger (Medizinischer Direktor und Stellvertretender Spitaldirektor)